同熱注射用水設備相比較，冷注射用水設備較不多見，其需要認真的監測與仔細的管理。就算選用抑菌空氣排出過濾器或是儲水箱氮封的方式，病菌也無可避免的將進入系統中，因此，日常的監測是至關重要的。只需溫度維持比較低，便能降低細菌的繁殖。10℃上下的溫度就能夠抑制絕大多數病菌成長，因此冷循環系統大都在小于25℃的條件下運作。通常采用熱交換器借助外界冷卻水為冷媒開展降溫。清除因為泵的運能或從房頂空間的比較高工作溫度獲得的能量。因為紫外線輻射能夠產生自由羥基從而使自身所產生的熱原產生氧化，因此，在冷循環系統里選用紫外線滅菌設備能夠提供進一步的滅菌保護。病菌會滋生，特別是當體系長期不用時，這種情況會對熱原的數量水準產生影響。當病菌的數量達到不可接受的水平時，體系必須停止運行，開展滅菌。現階段，大多數體系選用自動滅菌設計，這一設備可以采用熱力或是臭氧開展夜間滅菌。